Phylogeny.fr: robust phylogenetic analysis for the non-specialist
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Abstract
Phylogenetic analyses are central to many research areas in biology and typically involve the identification of homologous sequences, their multiple alignment, the phylogenetic reconstruction and the graphical representation of the inferred tree. The Phylogeny.fr platform transparently chains programs to automatically perform these tasks. It is primarily designed for biologists with no experience in phylogeny, but can also meet the needs of specialists; the first ones will find up-to-date tools chained in a phylogeny pipeline to analyze their data in a simple and robust way, while the specialists will be able to easily build and run sophisticated analyses. Phylogeny.fr offers three main modes. The 'One Click'…
Citation impact
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- 65.27
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Authors
12- ADAlexis DereeperCorresponding
Centre National de la Recherche Scientifique, Centre de Gestion Scientifique, Génétique Médicale & Génomique Fonctionelle
- VGValentin Guignon
Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Montpellier, Centre de Gestion Scientifique, Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement, Laboratoire Information Génomique et Structurale
- GBGuillaume Blanc
Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Montpellier, Centre de Gestion Scientifique, Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement, Laboratoire Information Génomique et Structurale
- SAStéphane Audic
Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Montpellier, Centre de Gestion Scientifique, Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement, Laboratoire Information Génomique et Structurale
- SBSylvain Buffet
Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Montpellier, Centre de Gestion Scientifique, Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement, Laboratoire Information Génomique et Structurale
Topics & keywords
- Phylogenetic tree
- Phylogenetics
- Biology
- Pipeline (software)
- Tree (set theory)
- Computer science
- Rendering (computer graphics)
- Data mining