A Spatial Statistical Model for Landscape Genetics
Département mathématiques, informatique, sciences de la donnée et technologies du numérique · Mathématiques et Informatique Appliquées · +6 more institutions
Abstract
Landscape genetics is a new discipline that aims to provide information on how landscape and environmental features influence population genetic structure. The first key step of landscape genetics is the spatial detection and location of genetic discontinuities between populations. However, efficient methods for achieving this task are lacking. In this article, we first clarify what is conceptually involved in the spatial modeling of genetic data. Then we describe a Bayesian model implemented in a Markov chain Monte Carlo scheme that allows inference of the location of such genetic discontinuities from individual geo-referenced multilocus genotypes, without a priori knowledge on populational units and limits.…
Citation impact
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- 8.52
- Percentile
- 100%
- References
- 33
Authors
4- GGG. GuillotCorresponding
Département mathématiques, informatique, sciences de la donnée et technologies du numérique, Mathématiques et Informatique Appliquées
- AEArnaud Estoup
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Arts et Métiers, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations, Institut de Recherche pour le Développement
- FMFrédéric Mortier
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Forêt Méditerranéenne
- JCJean‐François Cosson
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Arts et Métiers, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations, Institut de Recherche pour le Développement
Topics & keywords
- Population
- Population genetics
- Biology
- Spatial analysis
- Panmixia
- Inference
- Linkage disequilibrium
- Genetic structure
- Life in Land